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古代
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商周时期属百越。
秦代，秦始皇三十三年（前214年）归属南海郡番禺县。汉代循之。三国时属东吴广州。隋唐之后归南海。
自北宋中期起，区境东部、北部属番禺，西南部归南海。
明清时期，归属番禺县慕德里巡检司、鹿步巡检司、南海县金利司、三江司。
中华民国时期
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中华民国十三年（1924年），孙中山以大元帅命令核准广州市区域东至东圃、车陂，南至河南黄埔（村），北至白云山脚，西至增埗对河两小岛。民国二十年（1931年），番禺县属有部分村庄划入广州市。民国二十六年（1937年）六、七月旬，广州市区扩大，北郊、西郊和东郊原来归属番禺县的彬社、公和、敦和、崇文、沥滘、车陂、石牌、冼猎杨、龙洞堡及南海县的上下恩洲划归广州市管辖。
抗日战争爆发后，民国二十七年（1938年）年10月，广州市沦陷。划入广州市的十个乡仍划归番禺、南海两县管辖。
民国三十六年（1947年），广州市乃将十乡归市属列为郊区，设恩洲、龙洞堡、石牌、冼猎杨、彬社、公和、敦和、崇文、沥滘、崇文9个郊区。民国三十七年（1948年）7月，市政府第55次会议议决将市郊9个区调整为6个郊区。[5]
中华人民共和国广州市郊区时期
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中华人民共和国成立后，广州市人民政府于1949年11月第一次进行市属区域调整。郊区调整为7个行政区。1951年6月，7个郊区又调整为4个郊区。1953年6月，将番禺县部分地区划入广州市，成立黄埔区。1954年6月，又将4个郊区合并为黄埔、白云、新滘等3个郊区。1956年6月，将3个郊区合并为广州市郊区。
1958年1月，番禺县珠江河以北地区（禺东、禺北）划归广州市，番禺县属17个乡、1个镇、23个墟市、474个自然村、344个农业生产合作社，与增城县4个农业生产合作社的28个自然村，一同划入广州市郊区。同年8月，郊区成立12个人民公社。
1958年底，郊区的人和、太和、竹料、钟落潭等4个公社划出，与花县合并为广北县，其余的三元里、鹤洞、江村、石井、沙河、新滘、黄埔、萝岗等8个公社成立近郊区，撤销郊区。1959年3月，由于国务院没有批准广北县的设置，原郊区划出给花县的4个公社划回郊区，撤销近郊区，恢复花县与广州市郊区的设置。
1960年6月，城市人民公社化运动开展后，撤消郊区，成立2个以工矿企业为中心的人民公社；同年7月改为区。1962年5月，芳村、江村、黄埔3个区合并成立郊区。1965年3月，郊区人和、江村、石龙3个公社及江高镇、雅瑶农场划给花县。1967年1月又重新划回郊区。
1973年5月至1975年5月，黄埔公社7个大队与萝岗公社7个大队从郊区划出，组成黄埔区。1985年5月，郊区所属2个区公所和4个街道划出，成立天河区。郊区所属鹤洞区公所和白鹤洞街、芳村街划出，成立芳村区。1986年5月，郊区所属新滘区公所和赤岗街划给海珠区。
白云区时期
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1987年1月，国务院批准，广州市郊区更名为白云区，列入城区建制。辖15个镇、5个街道和一个渔业联社。
1987年8月，天河区同和镇及其所属的行政区域范围划归白云区管辖。同和镇的行政区域范围，除原管辖的同和、京溪两个村外，新市镇管辖的东平、永泰和三元里街管辖的柯子岭村划归同和镇管辖。
1988年11月，设置雅瑶镇，管辖原神山镇所属雅瑶村、雅瑶旧村、邝家庄、三向、岑境五个村。撤销槎头街道，设置松洲街道。石井镇螺溪村、河沙村、坦尾村划归松洲街道管辖。12月，设置景泰街道。管辖广园、景泰、云苑等新居民区。
1994年11月，设立同德街道。同德街以同德村为基础，同德村从石井镇划出。
1995年4月，设置良田镇。竹料镇八个村的行政区域划归良田镇管辖。
1999年8月，设立黄石街道。黄石街道管辖原新市镇的江夏、陈田2个村委会和江夏、外语学院2个居委会及原石井镇马务村的黄石花园和祥景花园2个小区。
2000年4月，设置新景街道，管辖原新市镇的棠涌、萧岗2个村委会和白云、棠涌、萧岗、汇侨、南航新村5个居委会；设置棠景街道，管辖原新市镇的棠溪、远景2个村委会和远景、合益、棠溪、新市一、新市二、侨爱苑6个居委会。
2000年9月，原市农工商集团公司12个行政村移交白云区管理。景泰街接收柯子岭村；同和镇政府接收京溪村、同和村、永泰村、东平村；萝岗镇政府接收黄陂村、八斗村华沙村；九佛镇政府接收山龙村、迳下村、红卫村、长庚村。
2000年11月，西郊、河沙、坦尾村（即大坦沙）划入荔湾区。
2001年6月，撤销同和镇，设立同和、京溪、永平三个街道，从7月10日起正式运作。
2002年8月，撤销石井镇，设立石井、金沙两个街道。撤销新市镇，设立嘉禾、均禾两个街道，同时撤销蚌湖镇并入人和镇[6]。
2002年9月，雅瑶镇划归花都区管辖。
2003年4月，撤销萝岗镇，设置萝岗街道。同年5月，萝岗街道辖内行政事务移交广州经济技术开发区管委会管理[7][8][9]。同年7月，新景街道更名为新市街道。
2004年，神山镇并入江高镇，龙归镇并入太和镇；竹料镇、良田镇、九佛镇并入钟落潭镇。
2005年5月，为配合广州市行政区划调整，将钟落潭镇九佛片（原九佛镇）和萝岗街道（原萝岗镇）划归新成立的萝岗区管辖；而矿泉街道改由越秀区管辖。[5]
2013年12月，设立云城街道，管辖原属新市街道的萧岗南、萧岗北、萧岗花园、明珠、齐富、连元桥等6个社区；设立鹤龙街道，管辖原属嘉禾街道的鹤南、鹤边、鹤北、时代玫瑰园、金碧雅苑、乐得、二矿、员村、黄边、尹边、彭上、彭西等12个社区；设立白云湖街道，管辖原属石井街道的夏茅富民、夏茅利民、兵房、大朗、大朗货场、环滘、大冈、唐阁、龙湖等9个社区；设立石门街道，管辖原属石井街道的红星亭岗、红星联兴、滘心、朝阳、鸦岗南、鸦岗北等6个社区。原属均禾街道的新村、科甲、长湴、双和、太和等5个社区划入嘉禾街道。[10]
2020年7月，太和镇一分为三，设立大源街道和龙归街道。[11][12]